實施兩稅合一後，營利事業計算所得額的規定及課徵營利事業所得稅所適用的稅率，
與兩稅合一實施前完全相同。不過，營利事業必須在其會計帳簿外，設置「股東可
扣抵稅額帳戶」，記錄可分配予股東的營利事業所得稅額；另外，公司自89年度起，
辦理各年度營利事業所得稅結算申報時，應併同辦理上年度未分配盈餘申報。所以，
實施兩稅合一後，營利事業在帳務處理上與兩稅合一實施前大抵相同，僅增加股東可
扣抵稅額帳戶的設置、記錄、股東稅額扣抵比率的計算及未分配盈餘加徵10%營利事業
所得稅的申報。