現行公司登記之受理機關，係依「實收資本額新台幣五億元」、及是否位於加工出口區、科學工業園區為分工原則，計有六個登記窗口如下：

經濟部商業司
外商認許、審定、報備、外國分公司、實收資本額新台幣五億元以上
及公司所在地在金門、馬祖地區之本 國公司
台北市福州街十五號
(02)23967333
經濟部中部辦公室
實收資本額未達新台幣五億元其所在地在台灣省轄區內之本國公司
南投縣中興新村省府路４號
(049)2315634
台北市政府建設局
實收資本額未達新台幣五億元其所在地在台北市轄區內之本國公司
台北市市府路１號
(02)27596019
高雄市政府建設局
實收資本額未達新台幣五億元其所在地在高雄市轄區內之本國公司
高雄市四維三路２號
(07)3373194
經濟部加工出口區管理處
　　加工出口區內之公司
高市楠梓加昌路600號
(07)3611212轉217
科學工業園區管理局
　　科學工業園區內之公司
新竹市新安路２號
(035)773310